在凭保函交付货物的情况下，收货人保证在收到提单后立即向船公司交回全套正本提单，承担应由收货人支付的运费及其他费用的责任，对因未提交提单而提取货物所产生的一切损失均承担责任，并表明对于保证内容由银行与收货人一起负连带责任。凭保函签发提单则使得托运人能以清洁提单、已装船提单顺利地结汇。
预付款保函：又称还款担保，是指向工程业主（受益人）保证，如申请人未能履约或未能全部按合同规定使用预付款时，则银行负责返还担保函规定金额（或未还部分）的预付款。预付款担保的担保金额不应超过承包人收到的工程预付款总额。
预付款保函如何避免风险?
1、常见生效条款：开立之日起生效;指定日期生效;指定事件生效。
2、常见失效条款：指定失效日期;指定失效事件。
不利的失效条款：事实性条款;不延期即付款或自动延期。
3、减额条款：如：保函金额随xx合同项下履行金额递减;或随验收金额递减。
应尽量采用：随申请人提交的每批货物的提单/发票按比例递减;随申请人提交的由受益人签署的验收证书金额递减。
4、金额敞口风险：赔付利率不明确、赔付币种与担保币种之间汇率不明确、承担无上限律师费和诉讼费等。
5、索赔条款：尽量避免索赔条款过于简单，给受益人不当索赔提供了便利，也可以增加索赔声明的内容。
6、转让风险：受益人要求保函项下的权利可单独转让的。增加了受益人索赔的不确定性，通常情况下应避免。
由于办理投标保函时要求办理人在该银行有长期、固定的存款，所以银行并没有承担资金风险。但这种方式并没有解决企业资金占用的问题，于是，在银行存有长期固定存款的担保公司，可以为企业代为办理投标保函。即降低了银行的风险，也降低了投标企业的资金占用压力，担保公司也可以获取相应的办理费用作为回报。如果发生违约事件后，银行、担保公司会通过法律手段向违约人进行追讨，这样也加大了违约的成本，降低了违约出现的可能性。